Aby koordinoval zhodu medzi rôznymi žľazami s vnútornou sekréciou, organizmus disponuje systémom kontrolných a regulačných mechanizmov, ktorý spravidla funguje v troch úrovniach:
hypotalamus - hypofýza - žľaza s vnútornou sekréciou.
V mozgu sa nachádzajú dve regulačné žľazy: hypotalamus a hypofýza.
Hypotalamus plní najčastejšie funkciu najvyššieho regulátora, pričom z nervovej sústavy dostáva informáciu o vonkajšom svete a vnútornom prostredí organizmu a podľa potrieb vysiela informačné látky, ktoré stimulujú alebo blokujú tvorbu, iným informačným látkam v prednom laloku hypofýzy.
Hormóny predného laloku hypofýzy majú vplyv na "podriadené" žľazy - napr. štítnu žľazu - ktoré zvyšujú alebo znižujú hormonálnu produkciu úmerne s potrebami.
Oblasť lekárstva, ktorá sa špecializuje na zisťovanie a liečenie porúch hormonálnej premeny sa nazýva endokrinológia.